El Mugen 6 se distingue por un disipador de calor completamente rediseñado. Además, se suministra con un ventilador Scythe Wonder de 120 mm. El disipador ofrece un 45% más de aletas, manteniendo al mismo tiempo una altura de solo 154 mm. Esta configuración con mayor densidad de aletas permite una mejor disipación del calor. Su diseño asimétrico garantiza una alta compatibilidad con la mayoría de los chasis y placas base. El ventilador cuenta con un diseño de vórtice de 9 aspas y un fiable rodamiento de fluidos dinámicos de precisión sellado. El sistema de montaje H.P.M.S. V, fácil de instalar, ofrece una presión de contacto óptima y compatibilidad con los últimos zócalos de CPU, incluyendo los LGA 1700 de Intel y los AM5 de AMD.